En sus 15 años con los Hombres de Negro, J (Will Smith) ha presenciado cosas inexplicable. Pero nada, ni siquiera los propios alenígenas, lo han desconcertado tanto como su irónico y reservado compañero.
Pero cuando la vida de K (Tommy Lee Jones) y el destino del planeta peligran, el agente J deberá viajar atrás en el tiempo para arreglar las cosas. J descubre que hay secretos del universo que K nunca le mencionó -secretos que se irán desvelando al formar equipo con un joven agente K (Josh Brolin) para rescatar a su compañero, la agencia y el futuro de la humandidad.
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