Basado en la exitosa serie de animación de Nickelodeon y en la película de Paramount Pictures, nos sitúa justo después de los hechos ocurridos en este film.
Los sueños de Bob Esponja están cobrando vida, alterando el espacio y el tiempo, lo que ha provocado que Fondo de Bikini está transformándose en otras ciudades. Y como no podía ser de otra forma, solamente Bob y sus amigos podrán unir todas las piezas del puzzle para dejar esta ciudad subacuática en su estado por defecto.
Hay seis personajes: Bob Esponja, Patricio, Calamardo, Arenita, Don Cangrejo y Plankton, los cuales se pueden transformar en un campeón superpoderoso.
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